生物过滤过滤材料挑选要考虑其吸水性，能否大程度的使硝化菌粘附，材料是不是非常容易脱层，易脱层的过滤材料必须常常拆换，不益于长期用，还会反倒环境污染水体。
生化球。生化球都是用的非常广泛的一种生物过滤材料，同样也可以培养硝化细菌，净化水质。可是生化球不能一直浸在水族鱼缸中，否则会导致其附载的硝化菌氧气不足，减少使用率。建议把生化球放在水和空气的结合体流过位置，在这儿有益于充分发挥它大的作用。
瓷器/玻璃环。陶瓷环是绿脓杆菌的优良住所，并且生物过滤功效极强，这类过滤材料一般被放到生化球下边，还可以单用。一般来说，玻璃环的面积越高，所产生的肠道益生菌也就越多，过滤效果就比较好，并且透气性能都比较好。同体积的玻璃环面积比陶瓷环要大一些6～8倍，能够为硝化菌提供更好的日常生活场地，夹层玻璃环的作用比陶瓷环好一些。玻璃环和陶瓷环一般不需要经常清理，当玻璃环和陶瓷环表层附带很多硝化菌尸体们才需要清理。
生物过滤过滤材料
多种不同名字类型的过滤材料实际上具体差别并不算太大。
病菌环：应用较多、更为普遍存在的一种生物过滤过滤材料。特点是经济实用，孔隙度比较大透水性透氧性好，有利于培养硝化细菌。主要缺点材料难题非常容易脱层，有一定的使用期。
细菌屋：病菌环的衍生品，二者材料差别不大，细菌屋块头更大一些。优势基本和病菌环一致，也是由于自身体积较大，在较大的过滤盒过滤缸中放置、维护保养下去方便。主要缺点小过虑不能使用，还会脱层，有一定的使用年限。
